مسی در سال ۲۰۰۷ بنیاد لئو مسی را تاسیس کرد. این بنیاد یک موسسهٔ خیریه است که وظیفهٔ حمایت از امور درمانی و تحصیلیِ کودکان آسیب پذیر را برعهده دارد.^[۳۴۰]با توجه به سختی های درمانی-پزشکی که لیونل مسی در دوران کودکی با آن ها دست و پنجه نرم می کرد، بنیاد لئو مسی پیشنهاد حمایت از درمانِ کودکانی که در اسپانیا نیازمندِ درمان تشخیص داده شده اند را مطرح کرد و حمایت مالی برای هزینه های انتقال،بیمارستان و بهبودی را بر عهده گرفت.^[۳۴۱]بنیاد مسی توسط سرمایهٔ شخصی خود او و با کمکِ شرکت هربالایف تامین می شود.^[۳۴۲]

مسی در ۱۱ مارس ۲۰۱۰ به عنوان سفیر صلح یونیسف انتخاب شد. فعالیت های مسی به عنوان سفیر صلحِ یونیسف شامل حمایت از حقوق کودکان می شود. مسی در این زمینه توسط بارسلونا که خود همکاری زیادی با یونیسف دارد حمایت می شود.^[۳۴۳]

او و نیولز اختلاف عمومی طولانی مدت خود را پایان بخشیده اند. مسی برای آکادمی جوانانِ باشگاه، ساختمان یک خوابگاه شبانه روزی را در استادیوم نیوولز احداث نموده است. وی همچنین یک ورزشگاهِ کوچک نیز برای باشگاه ساخته است. نیوولز نیز برای ابراز خوشنودی از پایان اختلافشان با مسی برنامه دارد تا یک کارتِ خاصِ عضویت در باشگاه را به نام پسر مسی تدوین و چاپ نماید.^[۳۴۴]

مسی در مارس ۲۰۱۳ ششصد هزار یورو برای بازسازی یک بیمارستانِ کودکان در زادگاهش روزاریو در آرژانتین اهدا کرد.^[۳۴۵]این پول برای بازسازی واحد تومور شناسی و غده شناسی در بیمارستان کودکان جِی ویلِلا به کار رفت و هم چنین به عنوان هزینهٔ سفر پزشکان به بارسلونا جهت درمان بیماران به کار گرفته شد.^[۳۴۶]